漫画描きから言わしてもらうと、単なる流れの慣習の問題ではなく
横書きのフキダシはおさまりが悪いんだよ。
一番沢山出て来る画題である人物が縦長の物体だからね。
横書きは人物像と相性が悪いんだ。

同じ理由で映画の字幕なんかでも縦書きが根強い。